VACATURE

Afstudeerproject Deep Dory – Deep learning technieken voor soorten herkenning van marinelarven en -eieren

Afstudeerproject geschikt voor een master gerelateerd aan Marine Sciences, Ecologie en/of Biologie.

Context: Vissen hebben een belangrijke rol in het koraalrif ecosysteem en de veerkracht hiervan. Momenteel worden vissen uit het wild gehaald voor dierentuinen en aquariums omdat het kweken in gevangenschap moeilijk is. Het kweken van zoutwatervissen is een groeiende wetenschap en een aantal instituten hebben grote stappen gezet. De reproduceerbaarheid van deze wetenschap is laag en dit is cruciaal om aquaria duurzamer te maken. RoffaReefs is een start-up bedrijf opgericht in Diergaarde Blijdorp dat een drijvend viskweeksysteem ontwikkelt voor marinelarven in aquaria en op zee gebruik makend van zonne-energie. Het kweeksysteem wordt momenteel getest op het koraalrif in Bonaire in samenwerking met het Wereld Natuur Fonds Dutch Caribbean.

Uitdagingen: Voordat het kweeksysteem ingezet kan worden is er meer kennis nodig over de ontwikkeling van pelagische rifvissen. Het is belangrijk dat alleen de juiste soorten worden geselecteerd voor ons drijvend kweeksysteem, zonder schade toe te brengen aan andere larven en eieren die tegelijkertijd in het water drijven rond het systeem. De vraag is: hoe kunnen we gebruikmaken van computer vision en machine learning technieken voor soorten herkenning met behulp van een database van foto’s van eitjes en larven gekoppeld met DNA-analyses van de verzamelde monsters?

Het doel van dit project is het ontwikkelen van data-driven methodes die gebruikt kunnen worden binnen het kweeksysteem die helpen met het selecteren van de juiste soorten, zonder dat de eieren en larven worden benadeeld in het systeem.

We bieden een plek aan voor een afstudeerstage bij HKV in samenwerking met RoffaReefs. HKV is kennisondernemer voor watermanagement en nature based solutions en is expert in het implementeren van de laatste ontwikkelingen van deep learning in praktische oplossingen.

Je zult nieuwe codes ontwikkelen, nieuwe leerstrategieën ontwerpen en paden verkennen met behulp van computer vision en machine learning, begeleid en zelfstandig om het kweeksysteem te ontwikkelen tot een betrouwbare conservatie ‘tool’.

Voor meer informatie neem je contact op met:
Mattijn van Hoek, adviseur bij HKV (m.vanhoek@hkv.nl, 06 35119762)
Sander van Lopik, oprichter van RoffaReefs (s.van.lopik@diergaardeblijdorp.nl, 06 27171160)

dr. M. van Hoek MSc adviseur Producten en services m.vanhoek@hkv.nl